พ.ศ 2476

เมื่อย้อนอดีตไปสำนักเลขาธิการนายกรัฐมนตรียังไม่ได้มีชื่อและอำนาจหน้าที่ อย่างที่เป็นอยู่ปัจจุบัน เป็นแต่เพียงหน่วยงานเล็กๆ ที่มีรากฐาน มาจาก สำนักงานเลขานุการนายกรัฐมนตรี ซึ่งจัดตั้ง ขึ้นตามพระราชบัญญัติ ปรับปรุง กระทรวง ทบวง กรม

พ.ศ. 2476 โดยเป็นหน่วยงานระดับกรมในสำนักนายกรัฐมนตรี ซึ่งทำหน้าที่ด้านเลขานุการให้แก่นายกรัฐมนตรี มีส่วนราชการใน สังกัดเพียง 2 แผนก คือ แผนกการเมืองและแผนกตรวจสอบ เรื่องราวและความเห็น

พ.ศ 2487

พระราชบัญญัติปรับปรุง กระทรวง ทบวง กรม (ฉบับที่ 8) พุทธศักราช 2487 ได้มีการยกฐานะสำนักงานเลขานุการนายกรัฐมนตรีขึ้นเป็น สำนักงานเลขาธิการนายกรัฐมนตรี เนื่องจากรัฐบาล เห็นว่าส่วนราชการนี้เป็น ส่วนราชการสำคัญและมีภารกิจเพิ่มมากขึ้น

พ.ศ 2496

พระราชบัญญัติปรับปรุง กระทรวง กรม พ.ศ. 2496 ได้เปลี่ยนชื่อ “สำนักนายกรัฐมนตรี” เป็น “สำนักคณะรัฐมนตรี”

มีการแยกงานในสำนักคณะรัฐมนตรีออกเป็น 2 ทบวง แยกเป็น (1) ทบวงคณะรัฐมนตรีฝ่ายการเมือง (2) ทบวงคณะรัฐมนตรีฝ่ายบริหาร และมีสำนักงานเลขาธิการนายกรัฐมนตรี ซึ่งมี อำนาจหน้าที่เกี่ยวกับราชการ ทางการเมืองของนายกรัฐมนตรีสังกัดอยู่

พ.ศ 2502

ได้มีพระราชบัญญัติจัดระเบียบราชการสำนักนายกรัฐมนตรี พ.ศ. 2502 เปลี่ยนชื่อ “สำนักคณะรัฐมนตรี” กลับเป็น “สำนักนายกรัฐมนตรี” ตามเดิม

พร้อมทั้งได้มีการจัดตั้งส่วนราชการระดับกรมขึ้นใน สำนักนายกรัฐมนตรี เพื่อปฏิบัติหน้าที่เกี่ยวกับราชการการเมืองและ งานเลขานุการของนายกรัฐมนตรีโดยเฉพาะ

คือ สำนักทำเนียบนายกรัฐมนตรี และสำนักบริหารของนายกรัฐมนตรี โดยที่สำนักทำเนียบนายกรัฐมนตรี (สำนักงานเลขาธิการนายกรัฐมนตรี ปรับเป็น สำนักทำเนียบนายกรัฐมนตรี) มีเลขาธิการทำเนียบนายกรัฐมนตรี ซึ่งเป็นข้าราชการการเมือง เป็นผู้บังคับบัญชารับผิดชอบขึ้นตรงต่อ นายกรัฐมนตรี สำนักบริหารของนายกรัฐมนตรี มีเลขาธิการบริหาร ของนายกรัฐมนตรี ซึ่งเป็น ข้าราชการการเมือง เป็นผู้บังคับบัญชา รับผิดชอบขึ้นตรงต่อนายกรัฐมนตรี

พ.ศ 2509

ได้มีการแก้ไขเพิ่มเติมกฎหมายว่าด้วยการจัดระเบียบราชการสำนักนายกรัฐมนตรี คือ พระราชบัญญัติจัดระเบียบราชการสำนักนายกรัฐมนตรี (ฉบับที่ 4) พ.ศ. 2508 ยุบเลิกสำนักบริหารของนายกรัฐมนตรีไปรวมกับ สำนักทำเนียบนายกรัฐมนตรี ต่อมาได้มีการปรับปรุงกฎหมายเกี่ยวกับ การบริหารราชการแผ่นดิน โดยได้มี พระราชบัญญัติแก้ไขเพิ่มเติมประกาศ ของคณะปฏิวัติฉบับที่ 216 ลงวันที่ 29 กันยายน 2515 (ฉบับที่ 5) พ.ศ. 2517 โดยเปลี่ยนชื่อจาก “สำนักทำเนียบนายกรัฐมนตรี” เป็น “สำนักเลขาธิการนายกรัฐมนตรี” เมื่อวันที่ 28 พฤศจิกายน 2517 จนถึงปัจจุบัน เนื่องจากยังไม่มีหน่วยราชการ ที่ทำหน้าที่รับผิดชอบ ราชการของนายกรัฐมนตรี รองนายกรัฐมนตรี รัฐมนตรีประจำ สำนักนายกรัฐมนตรี และที่ปรึกษานายกรัฐมนตรีโดยเฉพาะ

จึงสมควรจัดตั้งสำนักเลขาธิการนายกรัฐมนตรีขึ้นใน สำนักนายกรัฐมนตรี เพื่อทำหน้าที่เกี่ยวกับราชการทางการเมืองของนายกรัฐมนตรี รองนายกรัฐมนตรี รัฐมนตรีประจำสำนัก นายกรัฐมนตรี และที่ปรึกษานายกรัฐมนตรีหลังจากนั้นเป็นต้นมา

สำนักเลขาธิการนายกรัฐมนตรีได้มีการปรับปรุงอำนาจหน้าที่ และโครงสร้าง ส่วนราชการเรื่อยมา

พ.ศ 2559

ตามกฎกระทรวงแบ่งส่วนราชการสำนักเลขาธิการนายกรัฐมนตรี สำนักนายกรัฐมนตรี พ.ศ. 2559 กำหนดให้สำนักเลขาธิการนายกรัฐมนตรีมีภารกิจเกี่ยวกับการปฏิบัติราชการด้านการเมือง ด้านวิชาการ ด้านเลขานุการ ตลอดจนเป็นศูนย์ประสานการบริหารราชการ แผ่นดินของนายกรัฐมนตรี รองนายกรัฐมนตรี และรัฐมนตรีประจำสำนักนายกรัฐมนตรี รวมทั้งข้าราชการการเมืองสังกัด สำนักนายกรัฐมนตรี เพื่อให้การบริหารราชการแผ่นดินเป็นไปอย่างมี ประสิทธิภาพ มุ่งผลสัมฤทธิ์และ เป็นไปตามหลักการบริหารกิจการ บ้านเมืองที่ดี